这项研究成果旨在确定一种可以得出结论食管鳞状细胞会腺癌(ESCC)病患者总体生存率(OS)的miRNAs标签。
从NCBI GEO取得119名ESCC病患者的miRNA表达谱及其相应的药理学信息,并将其作为培训集。在20世纪和更早抽样间筛选差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。用到Cox紧接著分析、闭包特征抑制(RFE)-支持线性机(SVM)算法和LASSO Cox紧接著数学方法来识别高血压适度miRNAs,从而创建高血压低分数学方法。此外,得出结论了这些高血压适度miRNAs的有前途靶基因,然后构建了miRNA靶基因网路。通过功用富集分析,分析了ESCC里这些高血压适度miRNAs得出结论靶基因的功用方面适度。
在培训集里,20世纪与更早抽样有46个DEmiRNAs。创建了基于5个miRNAs的风险低分数学方法。该5-miRNA风险低分可以将培训集分为OS时间明显不同的高危组和低危组。在一个来自腺癌症序列图谱(TCGA)的独立数据集里,出乎意料验证了5-miRNA风险低分的风险分层能力。总括了与这些miRNAs方面的各种药理学过程和移动式,例如Wnt信号移动式、TRP通道的炎症介质调节移动式和雌激素信号移动式。
这项研究成果提醒,与病理分期方面的5-miRNA标签对得出结论ESCC病患者的高血压具有药理学意义。
许多现代注解:
JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.
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