Mol Cell:张锋催生三合一组合抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

近日，康乃尔大学和哈佛大学Broad研究者所传来好消息：Pardis C. Sabeti、张锋等科学家联合开发成一种新型的类似物系统会。世界上有许多常见的致命病原体都是基于脱氧核糖核酸RNA的毒株，像是疟疾毒株、山下卡毒株和流感毒株。该系统会在CRISPR Cas13关键技术的基础上再次升级，可常用测定和破坏人类细胞里面兼具脱氧核糖核酸RNA的毒株。该研究者发表在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR系统会为类似物方式造成了曙光在此之前，张锋团队的研究者工作人员凭借着CRISPR/Cas9系统会为加固免疫系统会抵类似物并吞造成了在此之后期盼。然而，并吞人类的毒株极为多变，即使是在同一群落内，也能不停考虑到环境。因此我们需要更为灵活的预防毒株游戏平台。为了冒险在此之后类似物策略，研究者工作人员将眼光投向了CRISPR Cas13系统会，Cas13酶可以天然地抗病毒酵母菌里面的毒株RNA。它可以对蛋白质进行时编程，从毒株颗粒里面去除特定的核糖核酸基因组。尽管CRISPR Cas13系统会仍然存在一些在实践中，但是该方式在试验室里面易于操作，并且在此之前张锋团队的研究者工作人员在动物细胞里面已经进行时了充份的试验证明。研究者工作人员开发了一种名为CARVER的新型游戏平台，它能将Cas13介导的毒株RNA催化与基于Cas13的较慢诊断读数结合起来，可用特定的高灵敏度酶报告分子结构解锁（SHERLOCK）游戏平台，测定消灭基于RNA的毒株。创建三合一的系统会研究者工作人员首先筛选了350多个人类系统性毒株（HAV）DNA，以鉴别Cas13可以合理抗病毒的毒株RNA基因组。他们主要寻找的是既不易基因，又最可能会在切割后去除毒株的片段。毒株DNA里面潜在的Cas13目的位点哈佛大学Cameron Sabeti试验室的研究员Myhrvold博士表示：“前提，你可以编程Cas13来袭击毒株的任何一小。但是群落内部和群落之间都有巨大的自然环境，随着毒株的灵长类，大一小DNA都发生了迅速的变化。如果你不小心，你则会自觉之后没合理果的目的。”然后，他们通过计算分析测序数据集，以确定数百种毒株群落里面的数千个潜在位点，这些位点可能会是Cas13的合理靶标。再一，研究者工作人员建筑设计了该系统会的Cas13监督RNA。新编程的Cas13在感染了淋巴细胞性脉络膜脑膜炎毒株（LCMV）、乙型流感毒株（IAV）和水泡性口炎毒株（VSV）的人类细胞里面进行时了试验次测试。将Cas13引入探针后24足足，研究者工作人员观察到培植物里面毒株RNA的总体减少了40倍。随后，研究者工作人员定期检查了Cas1可抑制毒株脑膜炎的能力。研究者数据集说明了：毒株掩盖后八足足，Cas13将流感毒株的幽默感减少了300倍以上。之前，该团队可用SHERLOCK测定关键技术来同步精确测量Cas13抗病毒后的毒株RNA总体。该测定系统会提供了有关治果的较慢测试者以及有关特定毒株基因的信息。篇章对于酵母菌感染的用药，虽然已经批复了90多种抗病物，但它们不用用药9种疾病。总体而言，只有16种毒株兼具FDA批复的抗病毒。因此，找到行之合理的类似物方式过分尤为重要。该研究者的第一作者 Catherine Freije 表示：“Cas13可以是一种研究者应用软件，来冒险人类细胞里面毒株生物科学的许多方面，它也可能会是一种外科应用软件，常用诊断样本，用药酵母菌感染，并衡量用药的合理性——所有这些都能让CARVER在在此之后或HIV毒株消失时迅速考虑到和应对。”原始成处:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]