Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘出出人类肠道的微生态系统目录!

2022-01-24 01:02:27 来源:
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近日,一项发表在国际杂志Nature Biotechnology上篇名“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究已成果报告当中,来自北美生物新科技的实验室等该机构的化学家们通过研究已成果将全人类肠胃化学物质组成员当中所有已知的芽孢遗传组成员编订已成了一个大型的图表库,从而就能借助研究已成果执法人员深入即使芽孢遗传和蛋白相互间的关联,以及其对全人类身心健康的影响。

芽孢遍布生物肝细胞外,其能够造成了核酸来影响RX-磨碎、身心健康和对疾病的易感性,其如此多数以至于生物体化学物质组成员已成员的数量要比人**还要多,包括芽孢、真菌和其它化学物质;为了阐释芽孢在全人类生物学当中所扮演的极其重要主角,化学家们通常会在的实验室当中分离并对其养成,随后在对芽孢开展DNA生物新科技,然而现在很多芽孢还无法在的实验室的环境当中被养成繁殖。

为了获得这些芽孢的相关信息,研究已成果执法人员采取了另外一种分析方法,他们从环境当中(比如肠胃)收集单一样本,随后在对整个样本当中的DNA开展生物新科技,然后利用计算机分析方法对来自单一样本当中的数千种特有种的个体遗传组成员开展重建,这种分析方法被称之为恒遗传组成员学新科技,该新科技能作为一种替代分析方法对单个特有种的DNA开展分离和生物新科技。

研究已成果者Rob Finn表示,去年包括我们在内的三个分立设计团队重建了上百个肠胃化学物质组成员遗传组成员,而较大的问题就是这些设计团队所给与的结果有否带有可比性,以及有否能将这些结果编订已成为一个非常全面的清单。现在研究已成果执法人员仍未从全人类肠胃当中超过4600种芽孢群落当中编订了20万个遗传组成员和1.7亿个核酸碱基,这种新型的图表库(统一的全人类胃肠胃遗传组成员子集和统一的胃肠胃核酸目录)揭示了RX-肠胃的庞大多样性,并为进一步开展肠胃化学物质组成员研究已成果铺平了道路。

研究已成果者绘制造出的这个庞大的目录是化学物质组成员研究已成果的一个里程碑,将会或将能为化学家们提供非常宝贵的自然资源来研究已成果全人类肠胃生态系统当中每一种芽孢所扮演的极其重要主角。这项研究已成果得造出结论,超过70%被检测到的芽孢从而在的实验室当中被已成功养成过,而其在肝细胞的活性依然未知,而这类芽孢当中较大的群体就是Comantemales;研究已成果者表示,看到Comantemales如此广泛真是一个惊喜,这就凸显了我们的确对肠胃当中的芽孢知之甚少,我希望这个目录能借助生物信息学家和生物新科技家在将会几年弥补这一学问反之亦然。

该图表库/目录收集的所有图表都能在在线自然资源Mgnify当中获得,其能借助化学家们分析化学物质的遗传组成员图表并且与当前的图表库开展对比;随着世界各地研究已成果设计团队不断披露在此之后图表库,该目录不会扩大到包括其它RX-臀部的化学物质组成员,比如黏膜或口腔之下等臀部。仍要研究已成果者表示,这一目录的编订将会或为化学物质学家和医学研究已成果执法人员提供非常丰富的自然资源,然而研究已成果执法人员不会在南美洲、大洋洲和非洲等代表性不足的地区发现格外多在此之后芽孢特有种,现在研究已成果执法人员非常清楚不同群体当中芽孢多样性的差别和叠加情况。

零碎造出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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