Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出生命体肠道的微生态系统目录!

2022-01-10 01:09:38 来源:
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近日,一项刊载在的国际刊物Nature Biotechnology上新书“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究课题报告里,来自欧洲药理学研究团队等管理机构的科学家们通过研究课题将全人类肾脏细菌四组里所有已知的病原体DNA摘要成了一个大型的图表库,从而就能借助研究课题其他部门有系统即使病原体蛋白质和蛋白之间的相似性,以及其对全人类心理健康的影响。

病原体遍布人游离外,其能够消除胺基酸来影响MS消化、心理健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体细菌四3人的总数要比人体细胞还要多,还包括病原体、真菌和其它细菌;为了理解病原体在全人类生物学里所扮演的决定性角色,科学家们通常会在研究团队里分离并对其人才,随后在对病原体开展DNADNA,然而现阶段很多病原体还无法在研究团队的周边环境里被人才生殖。

为了获得这些病原体的相关反馈,研究课题其他部门采取了另外一种方法有,他们从周边环境里(比如肾脏)采集实体检验,随后在对整个检验里的DNA开展DNA,然后数据处理方法有对来自实体检验里的数千种物种的生殖DNA开展复建,这种方法有被指宏DNA学技术,该技术能作为一种替代方法有对单个物种的DNA开展分离和DNA。

研究课题成果Rob Finn透露,去年还包括我们在内的三个独立团队复建了数以千计个肾脏细菌四组DNA,而最大的问题就是这些团队所取得的结果究竟具有可比性,以及究竟能将这些结果摘要带进一个非常全面的清单。现阶段研究课题其他部门仍然从全人类肾脏里至少4600种病原体群落里摘要了20万个DNA和1.7亿个胺基酸序列,这种新型的图表库(统一的全人类肾脏DNA集合和统一的肾脏胺基酸第一版)揭示了MS肾脏的巨大丰富性,并为全面性开展肾脏细菌四组研究课题开端了道路。

研究课题成果绘制造出的这个巨大的第一版是细菌四组研究课题的一个开端,更进一步或将能为科学家们获取非常宝贵的人力来研究课题全人类肾脏生态系统里每一种病原体所扮演的决定性角色。这项研究课题表明,至少70%被检测到的病原体从而在研究团队里被成功人才过,而其在游离的活性几乎未知,而这类病原体里最大的群体就是Comantemales;研究课题成果透露,看着Comantemales如此广泛真是一个惊喜,这就凸显了我们的确对肾脏里的病原体知之甚少,我希望这个第一版能借助生物反馈学家和药理学家在更进一步几年弥补这一知识总数有限。

该图表库/第一版采集的所有图表都能在在线人力Mgnify里获得,其能借助科学家们分析细菌的DNA图表并且与近期的图表库开展对比;随着世界各地研究课题团队不断刊发属于自己图表库,该第一版就会扩展到还包括其它MS部位的细菌四组,比如皮肤或口腔核心等部位。最后研究课题成果透露,这一第一版的摘要更进一步或为细菌学家和临床研究课题其他部门获取非常丰富的人力,然而研究课题其他部门就会在厄瓜多尔、亚洲和非洲等代表性偏低的地区发现更多属于自己病原体物种,现阶段研究课题其他部门并不相符多种不同人群里病原体丰富性的差别和变化情况。

原始造出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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